Запись нового альбома протекала крайне медленно, отчасти из-за проблем с продюсированием, отчасти из-за наркотической зависимости музыканта. Тем не менее, звучание Whiskey for the Holy Ghost свидетельствует о растущем профессионализме Ланегана как композитора и вокалиста. Тексты Марка представляют собой исследования тёмных сторон человека (например, «Borracho» или «Pendulum») и демонстрацию красоты уязвимости («The River Rise», «Carnival», «Riding The Nightingale»). В записи «Borracho» принял участие Дэн Питерс из сиэтлской группы Mudhoney. Песня «The River Rise» вошла в документальны фильм «Hype!», повествующий о начале 1990-х и эпохе гранжа.