Интегрин альфа-10

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
(перенаправлено с «ITGA10»)
Перейти к навигации Перейти к поиску
Интегрин альфа-10
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1PT6, 1QC5, 1QCY, 2L8S, 2M32, 4A0Q

Идентификаторы
ПсевдонимыITGA10, PRO827, integrin subunit alpha 10
Внешние IDOMIM: 604042 MGI: 2153482 HomoloGene: 2697 GeneCards: ITGA10
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме ITGA10
Расположение в геноме ITGA10
Локус1q21.1Начало145,891,208 bp[1]
Конец145,910,111 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
3-я хромосома мыши
Хр.3-я хромосома мыши[2]
3-я хромосома мыши
Расположение в геноме ITGA10
Расположение в геноме ITGA10
Локус3|3 F2.1Начало96,552,900 bp[2]
Конец96,571,835 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001303040
NM_001303041
NM_003637

NM_001081053
NM_001302471

RefSeq (белок)

NP_001289969
NP_001289970
NP_003628

н/д

Локус (UCSC)Chr 1: 145.89 – 145.91 MbChr 3: 96.55 – 96.57 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Интегрин альфа-10 (α10) — мембранный белок, гликопротеин из надсемейства интегринов, продукт гена ITGA10, альфа-субъединица интегрина α10β1, рецептора для коллагена.

Интегрин альфа-10/бета-1 (α10β1) является рецептором для коллагена.[5]

Интегрин альфа-10 — крупный белок, состоит из 1145 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 127,6 кДа. N-концевой участок (1100 аминокислот) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и небольшой внутриклеточный фрагмент (22 аминокислоты). Внеклеточный фрагмент включает 7 FG-GAP повторов, VWFA домен, до 11 участков N-гликозилирования. Цитозольный участок включает GFFKR мотив.

Интегрин альфа-10 относится к интегринам с I-доменом (VWFA домен), которые не подвергаются ограниченному протеолизу в процессе созревания. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 2 изоформ.

Тканевая специфичность

[править | править код]

Интегрин α10β1 широко представлен в различных тканях, наиболее высокий уровень экспрессии — в мышцах и сердце. Присутствует также в суставных хрящах.

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143127 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000090210 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Uniprot database entry for ITGA10 (accession number O75578). Дата обращения: 7 марта 2012. Архивировано 16 февраля 2018 года.

Библиография

[править | править код]