Подобно другим аквапоринам аквапорин 8 является тетрамерным интегральным белком. Мономер состоит из 261 аминокислоты, содержит 2 тандемных повтора с 3 трансмембранными участками и петлю с характерным мотивом аспарагин-пролин-аланин, которая формирует водный канал.
↑Koyama N., Ishibashi K., Kuwahara M., Inase N., Ichioka M., Sasaki S., Marumo F. Cloning and functional expression of human aquaporin8 cDNA and analysis of its gene (англ.) // Genomics : journal. — 1999. — January (vol. 54, no. 1). — P. 169—172. — doi:10.1006/geno.1998.5552. — PMID9806845.